Детали механизма восстановления последовательности днк
Несколько исследователей из америки, Украины и Мексики продемонстрировала, что неравномерная проводимость молекулы ДНК оказывает помощь восстанавливающим ферментам обнаружить поврежденные участки последовательности.
Структура гена
(иллюстрация из Talking Glossary of Genetics)
Kак известно, простой ген может содержать от тысячи до миллиона пар оснований, а «протяженность» мутаций образовывает всего около 10 пар. Возможность того, что репаративный фермент случайно найдёт такую мутацию, мала; следовательно, ферменты должны ориентироваться по трансформациям каких-либо черт ДНК.
Механические и термодинамические особенности молекулы фактически не изменяются при малых вариациях последовательности ДНК, тогда как электрическое сопротивление заметно колеблется кроме того при исключения (замены) одного нуклеотида. Оставалось узнать, как ферменты смогут применять эти колебания для локализации мутаций.
Авторы совершили расчеты электрической проводимости из первых правил (без дополнительных эмпирических догадок) для людских генов BRCA, ADAM10, SNAP29 и SUHW1 и поняли, что различные области генов имеют различные особенности. Экзоны — сегменты, несущие данные о первичной структуре белка, — соответствуют проводникам, а некодирующие участки (интроны) являются фрагментами диэлектрика.
Так, последовательность ДНК разбивается на маленькие области, каковые легко различимы, что существенно упрощает поиск мутации. Эта догадка подтверждается данными опытов, в которых измерялось сопротивление ДНК с мутациями, приводящими к формированию рака.
Полная версия отчета ученых размещена в издании Physical Review B; препринт статьи возможно скачать с сайта arXiv.
Опубликовано вNanoWeek,
- Прошлая статья:Новый биоразлагаемый перевязочный материал
- Следующая статья:Самые популярные наночастицы страшны для здоровья
